Molekuláris biológiai eljárás, amivel a mikrobioma összetételéről kapunk részletes képet. Ilyen módszert használ az uBiome Explorer vizsgálat. A székletmintában jelen levő baktériumok genetikai állományát vizsgálja. Az eredmények alapján meg lehet mondani, milyen baktériumtörzsek alkotják a mikrobiomát. A mikrobioma összetételének ismerete segít azt eldönteni, hogy a vizsgálatot kérő mikrobiomája egészséges-e, szükség van-e valamilyen egészséget helyreállító támogatásra (pl. étrendi változtatásra vagy probiotikum szedésre). Az eredmény abban is segít, hogy érdemes-e széklettranszplantáció érdekében mintát gyűjteni.
