A kivont, majd elraktározott mikróba-tömeg visszaültetésére akkor lehet szükség, ha valamilyen ok miatt a korábbi, sajátnak tekintett vastagbél-mikrobioma egyensúlya, összetétele megváltozott, megromlott.

Ennek okai lehetnek:

– rövidebb-hosszabb antibiotikus kezelés: fertőzések, borrelliozis / Lyme terápia, Helicobacter pylori eradikációs kezelés stb.

– tervezett kórházi ellátás: a kórházi felvétel előtt célszerű a mikrobioma szuszpenzió elkészíttetése, és banki tárolása. A kórházi kezelések, esetleg kórházi rezisztens baktérium-törzsek által okozott bélfertőzések (pl. álhártyás vastagbélgyulladás).

– külföldi, egzotikus utazás: az idegen étkezési kultúra, esetleg higiéniai problémák igen gyakran maradandó módosulást okozhatnak a bél mikrobioma összetételében. Az utazás előtt levett, és eltárolt mikrobioma szuszpenzió nagy segítséget jelenthet az utazás utáni, bélfertőzéssel kapcsolatosan fellépő problémák enyhítésében.